Hígado y SARS-CoV-2: aspectos claves de la literatura / Liver and SARS-CoV-2: Literature key aspects

Resumen El nuevo coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave de tipo 2 (SARS-CoV-2), virus que se ha expandido por todo el mundo, produce una infección respiratoria aguda capaz de producir la muerte; sin embargo, el daño en otros órganos también es frecuente. Diversos estudios han evidenciado alteraciones en pruebas de lesión hepáticas, las cuales se han asociado con enfermedad grave y mayor estancia hospitalaria; así mismo, en la infección por el virus en pacientes con enfermedad hepática preexistente se observó una elevación significativa de las aminotransferasas durante el curso de la enfermedad y mayor riesgo de enfermedad grave. La explicación fisiopatológica de la afectación hepática en estos pacientes abarca el efecto citopático directo producido por la unión del virus a la enzima convertidora de la angiotensina II (ECA-II) a los hepatocitos y colangiocitos, una respuesta inmunitaria desproporcionada y, en algunos casos, la hepatotoxicidad por medicamentos.

Abstract The new severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), a virus that has spread around the world, causes an acute respiratory infection and it may also cause death. The damage that can cause in other organs is frequent. Many studies had also shown alterations in liver function tests, that are then related to serious illness and with hospitalization requirements. Moreover, in patients infected with the virus that had underlying liver disease, a significant increase in the level of aminotransferases was observed in the course of the disease. A greater risk of serious illness was also detected. The pathophysiological explanation of liver injury in those patients covers the direct cytopathic effect produced by binding the virus, the angiotensin-converting enzyme (ACE2) to the hepatocytes and the cholangiocytes, excessive immune response, and in some cases, drug-induced hepatotoxicity.

Detección de la tuberculosis con algoritmos de Deep Learning en imágenes de radiografías del tórax / Tuberculosis detection with deep learning algorithms in chest X-ray images / Detecção de tuberculose com algoritmos de aprendizagem profunda em imagens de raio-X do tórax

Se estima que en 2019 murieron alrededor de 1,4 millones de personas infectadas por tuberculosis, gran parte de ellos en países en desarrollo. Si la tuberculosis se hubiera diagnosticado oportunamente se habría evitado la muerte de las personas infectadas. Uno de los métodos de detección de tuberculosis más relevante es el análisis de radiografías del tórax; sin embargo, contar con profesionales altamente capacitados para el diagnóstico de la tuberculosis en todos los centros de salud es imposible en los países emergentes, este es uno de los principales motivos de que este método no sea ampliamente usado. En las últimas décadas las redes neuronales han tenido un papel muy relevante en la solución de problemas de la sociedad y en especial en el sector salud. Se ha empleado tres algoritmos de aprendizaje profundo reconocidos en el desarrollo de visión computacional que son VGG19, MobileNet e InceptionV3, se ha logrado obtener resultados muy auspiciosos para la detección de la tuberculosis. Caso especial ha sido MobileNet que ha destacado entre las demás, dando resultados importantes en las diferentes métricas de evaluación empleadas. Además, MobileNet cuenta con una arquitectura menos compleja y los pesos obtenidos después del entrenamiento son muy menores en comparación de los otros dos algoritmos. Se concluye que MobileNet es el algoritmo de Deep Learning más eficiente a comparación de VGG19 e InceptionV3, cuenta con mejor precisión para la detección de la tuberculosis y; el costo computación y tiempo de procesamiento es significativamente menor.

It is estimated that around 1.4 million people infected with tuberculosis died in 2019, most of them in developing countries. If tuberculosis had been diagnosed in time, the death of infected people would have been prevented. One of the most relevant tuberculosis detection methods is the analysis of chest radiographs; However, having highly trained professionals for the diagnosis of tuberculosis in all health centers is impossible in emerging countries, this is one of the main reasons why this method is not widely used. In recent decades, neural networks have played a very relevant role in solving problems in society and especially in the health sector. Three recognized Deep Learning algorithms have been used in the development of computational vision that are VGG19, MobileNet and InceptionV3, it has been possible to obtain very auspicious results for the detection of tuberculosis. MobileNet has been a special case, which has stood out among the others, giving important results in the different evaluation metrics used. In addition, MobileNet has a less complex architecture and the weights obtained after training are very less compared to the other two algorithms. It is concluded that MobileNet is the most efficient Deep Learning algorithm compared to VGG19 and InceptionV3, it has better precision for the detection of tuberculosis and the computational cost and processing time is significantly lower.

Estima-se que cerca de 1,4 milhão de pessoas infectadas com tuberculose morreram em 2019, a maioria delas em países em desenvolvimento. Se a tuberculose tivesse sido diagnosticada a tempo, a morte de pessoas infectadas teria sido evitada. Um dos métodos de detecção de tuberculose mais relevantes é a análise de radiografias de tórax; No entanto, ter profissionais altamente capacitados para o diagnóstico da tuberculose em todos os centros de saúde é impossível nos países emergentes, esse é um dos principais motivos pelo qual esse método não é amplamente utilizado. Nas últimas décadas, as redes neurais têm desempenhado um papel muito relevante na resolução de problemas na sociedade e principalmente no setor da saúde. Três algoritmos de aprendizado profundo reconhecidos foram usados no desenvolvimento da visão computacional que são VGG19, MobileNet e InceptionV3, sendo possível obter resultados muito auspiciosos para a detecção da tuberculose. A MobileNet tem sido um caso especial, que tem se destacado entre os demais, apresentando resultados importantes nas diferentes métricas de avaliação utilizadas. Além disso, o MobileNet possui uma arquitetura menos complexa e os pesos obtidos após o treinamento são muito menores em comparação com os outros dois algoritmos. Conclui-se que o MobileNet é o algoritmo de aprendizado profundo mais eficiente em comparação ao VGG19 e ao InceptionV3, possui melhor precisão para detecção de tuberculose e; o custo de computação e o tempo de processamento são significativamente menores.

Epithelial-to-mesenchymal transition induced by virus / Transición epitelio-mesénquima inducida por virus

RESUMEN La Transición Epitelio-Mesénquima (EMT) es un proceso de diferenciación altamente conservado en vertebrados. Este ocurre en células epiteliales con la activación progresiva de la pérdida de la polaridad, la adquisición de motilidad individual y la capacidad invasiva a otros tejidos. La EMT es un proceso normal durante el desarrollo; no obstante, en condiciones patológicas está relacionada con la inducción de metástasis, lo cual representa una vía alterna al desarrollo de procesos oncogénicos tempranos. Aunque la EMT es activada principalmente por factores de crecimiento, también se puede desencadenar por infecciones de patógenos intracelulares mediante la activación de rutas moleculares inductoras de este proceso. Por lo tanto, una infección bacteriana o viral pueda generar predisposición al desarrollo de tumores. Nuestro interés está enfocado principalmente en caracterizar la relación virus-hospedero, y en el caso de los virus, varios ya se han descrito como inductores de la EMT. En este artículo de revisión se describen el fenómeno de la plasticidad celular y la ocurrencia detallada del proceso de EMT, los patógenos virales reportados como inductores, los mecanismos moleculares usados para ello y las vías de regulación mediante miRNAs. Por último, se discute cómo esta relación virus-hospedero puede explicar la patogénesis de la enfermedad causada por Dengue virus, favoreciendo la identificación de blancos moleculares para terapia, estrategia conocida como Antivirales dirigidos a blancos celulares o HTA (Host-targeting antivirals).

ABSTRACT Epithelial-to-Mesenchymal Transition (EMT) is a highly conserved dedifferentiation process in vertebrates. This process occurs in epithelial cells activating progressive loss of cell polarity, acquisition of individual motility and invasive capacity to other tissues. EMT is a normal process during development process, however, in pathological conditions is related to the induction of metastasis, which represents an alternative path to the development of early oncogenic processes. Although, EMT is mainly activated by growth factors, it can also be triggered by intracellular-pathogen-infections by activating molecular pathways that induce this process. Therefore, a bacterial or viral infection may generate predisposition to the development of tumors. Our interest is mainly focused on characterizing the host-virus relationship, and in the case of viruses, several have already been described as EMT inductors. In this review, phenomenon of cellular plasticity, detailed occurrence of the EMT, viral pathogens reported as inducers, the molecular mechanisms, and the regulatory pathways through miRNAs are described. Finally, we discuss how this host-virus relationship may explain the pathogenesis of the disease caused by Dengue virus, favoring the identification of molecular targets for therapy, a strategy known as Host-Targeting Antivirals (HTA).

Genetic diversity and population structure of endangered rosewood from the Peruvian Amazon using ISSR markers

Rosewood, Aniba rosaeodora is an endangered species in Amazon forests and its natural stands have been heavily depleted due to over-exploitation for the cosmetic industry. This study aimed to investigate the genetic diversity and population structure of 90 rosewood accessions from eight localities in the Peruvian Amazon through 11 Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) primers. The ISSR primers produced a sum of 378 bands, of which 375 (99.2%) were polymorphic, with an average polymorphism information content (PIC) value of 0.774. The mean effective number of alleles (Ne), Shannon informative index (I), gene diversity (He) and total gene diversity (Ht) were 1.485, 0.294, 0.453 and 0.252, respectively. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed the presence of maximum variability within populations (88%). The Structure algorithm, neighbor joining and principal coordinate analysis (PCoA) grouped the 90 rosewood accessions into three main populations (A, B and C). Diversity indices at the inter-population level revealed a greater genetic diversity in population A, due to higher gene flow. The neighbor-joining analysis grouped populations A and B, while population C was found to be divergent at the inter population level. We concluded that population A reflects higher genetic diversity and should be prioritized for future management and conservation plans. (AU)

Descubrimiento de fármacos basado en imagenología de células vivas / Drug discovery based on live cell imaging

RESUMEN El diseño eficiente de compuestos aprovechando las características estructurales de las moléculas y la búsqueda eficiente de dianas terapéuticas, ha proporcionado herramientas efectivas en la investigación de nuevos tratamientos cuando esta se enfoca en mecanismos celulares de la enfermedad. Los cambios fenotípicos producidos por la interacción in vitro entre molécula-diana, pueden controlarse cuantitativamente mediante imagenología de células vivas. Para garantizar una interacción adecuada, es necesario considerar diferentes elementos cruciales: 1. Las características estructurales y la dinámica molecular del compuesto a evaluar. 2. La relevancia del blanco para la fisiopatología de interés. Sin embargo, el desconocimiento del panorama general en el descubrimiento de fármacos, desde problemáticas estructurales y celulares, ha enlentecido la búsqueda de nuevos tratamientos. Esta revisión descriptiva de tema presenta algunos aspectos estructurales importantes para la caracterización de compuestos como candidatos terapéuticos, y aproximaciones experimentales para desarrollo de sistemas celulares. Los tópicos discutidos se enfocan en la monitorización por imagenología de células vivas y así mismo proporcionamos ejemplos relevantes. La monitorización de efectos fenotípicos producidos por interacciones entre candidato químico y blanco terapéutico en un sistema celular puede favorecer la búsqueda eficiente de moléculas potencialmente terapéuticas.

SUMMARY The efficient compounds' design taking advantage of the molecule's structural characteristics and efficient search for therapeutic targets has provided effective tools for the research of new treatments when this is focused on disease cellular mechanisms. Phenotypic changes produced by in vitro interaction between molecules and targets can be monitored quantitatively by live cell imaging. To guarantee adequate interaction, it is necessary to consider different crucial elements: 1. Structural characteristics and molecular dynamics of the evaluated compound. 2. Target relevance for the concern physiopathology. However, overview's ignorance of the drug discovery, from structural and cellular problems, has slowed the new treatments research. This literature review presents some important structural aspects for compounds' characterization as therapeutic candidates and experimental approaches for cellular systems development. Subjects discussed are focused on live cell imaging and we also provide relevant examples. Phenotypic monitoring of interactions' produced effects between the chemical candidate and therapeutic target in a cellular system can favor the efficient search of potentially therapeutic molecules.

Feeding habits of the fishes Euthynnus lineatus and Scomberomorus sierra (Perciformes: Scombridae) in the Eastern Tropical Pacific

Introduction: Black skipjack, Euthynnus lineatus, and Pacific sierra, Scomberomorus sierra, are of great economic importance in the small-scale fishery of the Tropical Eastern Pacific and in particular in the study area. Objectives: The objectives of the present study were to assess the diet components of E. lineatus and S. sierra, as well as to evaluate the niche width, trophic level, and trophic overlap between the two species, by size and season. Methods: Biological samples were obtained weekly from small-scale fishery catches in Bahía de Acapulco, Mexico. The E. lineatus sampling period occurred from October 2016 to October 2017, whereas S. sierra was sampled from October 2016 to June 2018. The Prey-specific Index of Relative Importance (% PSIRI) was used to evaluate the importance of each prey item in the diet of the predator. Levin´s index (Bi) was used as a measure of niche width. The Morisita-Horn index was used to evaluate diet overlap by size (juveniles or adults), by season (dry or wet), and between the two species. The trophic level (TL) of predators was calculated using the Cortés´ method. Results: A total of 262 E. lineatus stomachs were analyzed (42 % were empty and 58 % contained food) and a total of 209 S. sierra stomachs were analyzed (74.6 % were empty and 25.3 % contained food). Of the total E. lineatus specimens sampled, 107 were juveniles and 155 were adults. Black skipjack juveniles fed on five food items and adults fed on 13 food items. Of the total S. sierra specimens sampled, 75 were juveniles and 134 were adults. Pacific sierra juveniles and adults fed on five food items. The diet of the two species comprised fish, mollusks, and crustaceans. The two species showed narrow niche width. The diet of juvenile and adult E. lineatus presented differences with growth, contrary to what was observed for juveniles and adults of S. sierra. There were no significant differences in diet by season for both species. The trophic overlap obtained between the two species was low. The trophic level calculated for both species indicated that are tertiary consumers. Conclusions: Black skipjack and Pacific sierra are tertiary predators and present a specialist behavior, feeding mainly on fish from the families Engraulidae and Clupeidae. Although a degree of similarity in the dietary food components of these species was observed, there was not a high degree of interspecific competition for food.

Introducción: El barrilete negro, Euthynnus lineatus, y la sierra del Pacífico, Scomberomorus sierra, son peces que presentan gran importancia económica en la pesca artesanal del Pacífico Tropical Oriental y de manera particular en el área de estudio. Objetivos: Los objetivos del presente trabajo son determinar los componentes alimentarios de la dieta de E. lineatus y S. sierra, así como determinar la amplitud del nicho, el nivel trófico y el traslape trófico entre ambas especies, por tallas y por temporada climática. Métodos: Las muestras biológicas se obtuvieron semanalmente de las capturas realizadas por las pesquerías de pequeña escala llevadas a cabo en la Bahía de Acapulco. El periodo de muestreo de E. lineatus se realizó desde octubre 2016 hasta octubre 2017, mientras que el de S. sierra de octubre 2016 hasta junio 2018. El Índice de Importancia Relativa Específica de la Presa (% PSIRI) se usó para evaluar la importancia de cada ítem presa en la dieta del depredador; el índice de Levin (Bi) se usó como una medida de la amplitud del nicho; el índice de Morisita-Horn se usó para evaluar el traslape entre las dietas por talla (juveniles y adultos), por temporada climática (seca y lluviosa) y entre las dos especies. El nivel trófico (TL) de los depredadores fue calculado usando el método de Cortés. Resultados: Se analizaron en total 262 estómagos de E. lineatus (42 % vacíos y 58 % con alimento) y 209 estómagos de S. sierra (74.6 % vacíos y 25.3 % con alimento). Del total de organismos muestreados de E. lineatus, 107 se consideraron organismos jóvenes y 155 adultos. Los jóvenes de barrilete se alimentaron de 5 ítems alimentarios y los adultos se alimentaron de 13. En el caso de S. sierra, 75 organismos se consideraron jóvenes y 134 adultos. Los jóvenes y adultos de sierra se alimentaron de cinco ítems alimentarios. La dieta de ambas especies se compone por peces, moluscos y crustáceos. Las dos especies presentaron una amplitud del nicho trófico estrecho. La dieta de jóvenes y adultos de E. lineatus presentó diferencias alimentarias de acuerdo con su crecimiento, contrario a lo observado entre jóvenes y adultos de S. sierra. Entre temporadas climáticas, la dieta no presentó variaciones significativas en ambas especies. Asimismo, el valor de traslape trófico obtenido entre ambas especies fue bajo. El nivel trófico determinado para ambas especies indicó que son consumidores terciarios. Conclusiones: El barrilete negro Euthynnus lineatus y la sierra del Pacifico Scomberomorus sierra son depredadores terciarios y presentan un comportamiento especialista, principalmente sobre peces de las familias Engraulidae y Clupeidae. Aunque se observó una similitud en los componentes alimentarios de estas especies, no existe un alto grado de competencia interespecífica por el alimento.

Glycogen synthase kinase 3ß participates in late stages of Dengue virus-2 infection

BACKGROUND Viruses can modulate intracellular signalling pathways to complete their infectious cycle. Among these, the PI3K/Akt pathway allows prolonged survival of infected cells that favours viral replication. GSK3β, a protein kinase downstream of PI3K/Akt, gets inactivated upon activation of the PI3K/Akt pathway, and its association with viral infections has been recently established. In this study, the role of GSK3β during Dengue virus-2 (DENV-2) infection was investigated. METHODS GSK3β participation in the DENV-2 replication process was evaluated with pharmacological and genetic inhibition during early [0-12 h post-infection (hpi)], late (12-24 hpi), and 24 hpi in Huh7 and Vero cells. We assessed the viral and cellular processes by calculating the viral titre in the supernatants, In-Cell Western, western blotting and fluorescence microscopy. RESULTS Phosphorylation of GSK3β-Ser9 was observed at the early stages of infection; neither did treatment with small molecule inhibitors nor pre-treatment prior to viral infection of GSK3β reduce viral titres of the supernatant at these time points. However, a decrease in viral titres was observed in cells infected and treated with the inhibitors much later during viral infection. Consistently, the infected cells at this stage displayed plasma membrane damage. Nonetheless, these effects were not elicited with the use of genetic inhibitors of GSK3β. CONCLUSIONS The results suggest that GSK3β participates at the late stages of the DENV replication cycle, where viral activation may promote apoptosis and release of viral particles.

Embarazo y lesión hepática inducida por medicamentos. Reporte de un caso y revisión de la literatura / Pregnancy and drug-induced liver injury. Case report and literature review

La lesión hepática inducida por medicamentos o DILI (del inglés, Drug-Induced Liver Injury) es una condición relativamente rara, y más aún durante el embarazo. Usualmente es subdiagnosticada, y cuando se presenta en nuestro medio, pocas veces es notificada a los sistemas de registros nacionales, con un importante subregistro a nivel nacional y de Latinoamérica. Su forma de presentación clínica, tiempo de latencia, patrón de lesión hepática y reacciones idiosincráticas dificultan el diagnóstico oportuno, así como la ausencia tanto de pruebas diagnósticas objetivas, como de cambios histológicos patognomónicos que confirmen esta entidad. Se presenta el primer caso reportado en la literatura de una mujer en primer trimestre de gestación, quien cursó con DILI secundario al uso de tionamidas por sospecha clínica de hipertiroidismo.

Drug-induced liver injury (DILI) is a relative rare condition among general population and among pregnant women. It is usually underdiagnosed, and when identified, it is rarely notified to the national registry systems, especially locally, and in general in Latin America. Clinical presentation, time before symptom onset, patterns of liver injury and idiosyncratic reactions make an early diagnosis difficult, as well as the absence of diagnostic tests or histological changes that are unique to this pathology to confirm the diagnosis. We present the first case reported in the literature of a woman, who during the first trimester of pregnancy presented with DILI, secondary to the use of thionamides due to suspected hyperthyroidism.

LA PÉRDIDA DE FUNCIÓN DE LA QUINASA DEPENDIENTE DE CICLINA 5 (CDK5) ALTERA EL CITOESQUELETO Y REDUCE LA INFECCIÓN in vitro POR EL VIRUS DEL DENGUE 2 / The loss of function of Cyclin-Dependent Kinase 5 (CDK5) alters the Cytoskeleton and decrease the in vitro Dengue Virus-2 infection

RESUMEN La quinasa dependiente de ciclina 5 (CDK5) regula diversas funciones en neuronas, células endoteliales y epiteliales, entre ellas la dinámica del citoesqueleto. Así mismo, se ha reportado que componentes del citoesqueleto, tales como, filamentos de actina y microtúbulos juegan un rol importante durante la infección por el virus dengue (DENV). El objetivo del presente trabajo fue evaluar por dos métodos, inhibición química y silenciamiento génico, la participación de CDK5 durante la infección por DENV-2. La actividad antiviral de roscovitina fue evaluada usando ensayos de Unidades Formadoras de Placa (PFU). La eficiencia de transfección y el silenciamiento de CDK5, empleando miARNs artificiales, se determinó por citometría de flujo. El efecto sobre la proteína de envoltura viral y elementos del citoesqueleto se evidenció mediante microscopia avanzada de fluorescencia y análisis de imágenes. Roscovitina mostró actividad antiviral en etapas pre y post-infectivas en una forma dependiente de la dosis. El tratamiento con roscovitina y miRCDK5 mostró ser efectivo reduciendo la cantidad de CDK5 en células no infectadas. En células infectadas y transfectadas con miRCDK5, así como tratadas con el inhibidor, se observó una reducción significativa de la proteína de envoltura viral; sin embargo, no se encontró reducción significativa de CDK5. Además, el tratamiento con roscovitina indujo cambios celulares morfológicos evidentes en células infectadas. Los resultados indican la potencial participación de CDK5 durante la infección por DENV-2, posiblemente mediando la traducción proteica o la replicación del genoma viral a través de la regulación de la dinámica del citoesqueleto. Se requieren datos adicionales para esclarecer la mecanística del fenómeno usando métodos alternativos.

ABSTRACT Cyclin-Dependent Kinase 5 (CDK5) regulates several functions in neurons, endothelial, and epithelial cells, including the cytoskeleton dynamics. Likewise, it has been reported that some cytoskeleton elements, such as actin filaments and microtubules, play an essential role during Dengue virus (DENV) infection. This work aimed to evaluate the role of CDK5 during DENV-2 infection by two methods, chemical inhibition, and gene silencing. The antiviral activity of roscovitine was evaluated using Plaque Forming Units (PFU) assay. The transfection efficiency and knockdown of CDK5, using artificial miRNAs, was carried out by flow cytometry. The effect on the viral envelope protein and cytoskeleton elements was evidenced by advanced fluorescence microscopy and image analysis. Roscovitine showed antiviral activity in pre and post-infection stages in a dose-dependent manner. Treatment with roscovitine and miRCDK5 decrease the amount of CDK5 in uninfected cells. In cells infected and transfected with miRCDK5, as well as treated with the inhibitor, a significant reduction of the viral envelope protein was observed; however, no significant reduction of CDK5 was found. Also, evident morphological cellular changes were observed during the treatment with roscovitine in infected cells. The results indicate the potential participation of CDK5 during DENV-2 infection, possibly mediating protein translation or replication of the viral genome through the cytoskeletal dynamics regulation. Additional data are required to clarify the mechanistic of these phenomena using alternative methods.

Phylogenetic analysis of Dengue-2 serotypes circulating in mangroves in Northern Cordoba, Colombia

Abstract INTRODUCTION: In this study, we aimed to identify DENV-2 subtypes in Aedes aegypti pools collected between 2011 and 2017 in a rural area of Northern Cordoba, Colombia ("La Balsa"). METHODS: RT-PCR was performed to analyze the capsid/pre-membrane region (C-PrM). Sequencing and phylogenetic bayesian inference using reference DENV-2 sequences were performed. RESULTS: Twelve pools that tested positive for DENV-2 were characterized based on the C-PrM region and grouped under the Asian/American clade. CONCLUSIONS: This study is the first to report the DENV-2 Asian-American subtype in a rural area of Cordoba region, which is associated with severe dengue and local epidemics.

Estudio dinámico del reciclaje de envases pet en el Valle del Cauca / Dynamic study of pet containers recycling in Valle del Cauca / Estudo dinâmico da reciclagem de embalagens pet no Valle del Cauca

Resumen Introducción: El acelerado crecimiento de la población, los diversos patrones de consumo y la reducción en los ciclos de vida de los productos, han generado un incremento en el consumo y por tanto en la generación de residuos sólidos, los cuales si no se tratan de manera adecuada tienen efectos adversos al ambiente como muerte de animales por ingesta, inundaciones debido a la inadecuada disposición en canales de aguas lluvias y disminución de la vida útil de los rellenos sanitarios de materiales aprovechables. Uno de los residuos generados es el polietileno teraftalato (PET) que pese a ser un material 100% reciclable, está terminando en los rellenos sanitarios, disminuyendo la vida útil de los mismos y consumiendo recursos como el petróleo para la generación de materiales nuevos. Objetivos: Evaluar los efectos al ambiente del reciclaje del PET en el Valle del Cauca, a través de un modelo de dinámica de sistemas. Materiales y métodos: Se estudiaron variables como el consumo de agua y energía, generación de CO2 y la vida útil del relleno sanitario Colomba El Guabal que le sirve a municipios del Valle del Cauca, variando la tasa de reciclaje del PET. Resultados: El efecto de incrementar la tasa de reciclaje disminuye el consumo de agua y energía, la emisión de CO2 e incrementa la vida útil del relleno sanitario. Conclusiones: Es importante hacer seguimiento a las políticas de gestión de residuos en las principales variables ambientales y fortalecer los procesos de toma de decisiones, como aquellos relacionados con las opciones de diseño de productos y reutilización de materia prima, orientados a generar un impacto positivo en el ambiente.

Abstract Introduction: Fast population growth has generated an increase in the consumption and therefore it has influenced the rise of the solid waste generation, which causes adverse effects on the environment if treated inadequated. Polyethylene terephthalate (PET) is a kind of solid waste generated that is 100% recyclable, however it is ending in landfills reducing the lifespan of them and consuming resources like petroleum in order to generate new products. Objective: Evaluating the effect on the environment of PET recycling by means of a system dinamics model. Material and method: The variables considered were water and energy consumption, CO2 emissions and landfill lifespan varying the PET recycling rate. RESULTS: the increase of the recycling rate cause a decrease in water and energy consumption as well as de CO2 emissions and produce a rise in the landfill lifespan. Conclusions: It is still important to follow the acomplishment of the solid waste management policies so as to enhace the decision making process related to generate a positive impact on the environment.

Resumo Introdução: O acelerado crescimento a população, os diversos patrões de consumo e a redução nos ciclos de vida dos produtos, tem gerado um incremento no consumo e por tanto na geração de resíduos sólidos, em caso de não serem tratadas adequadamente tem efeitos adversos sobre o ambiente como a morte de animais pela ingestão, inundações devido à inadequada disposição em canais de águas de chuva e a diminuição da vida útil dos aterros sanitários de materiais aproveitáveis. Um dos resíduos gerados é o teraftalato de polietileno (PET) apesar de ser um material 100% reciclável, está acabando nos aterros sanitários, diminuindo a vida útil dos mesmos e consumindo recursos como o óleo para a geração de novos materiais. Objetivo: Avaliar os efeitos ao ambiente de reciclagem do PET no Valle del Cauca, através de um modelo de dinâmica de sistemas. Materiais e métodos: Estudaram-se variáveis como o consumo de água e energia, geração de CO2 e a vida útil do aterro sanitário Colomba El Guabal que serve aos municípios do Valle del Cauca, variando a taxa de reciclagem do PET. Resultados: O efeito de incrementar a taxa de reciclagem diminuindo o consumo de água e energia, a emissão de CO2 e o aumento da vida útil do aterro sanitário. Conclusões: É importante fazer seguimentos políticos de gestão de resíduos nas principais variáveis ambientais e melhorar os processos de tomada de decisões, como aqueles relacionados com as opções de desenho de produtos e reutilização de matéria prima, orientados a gerarum impacto positivo no ambiente.

Molecular detection of flaviviruses and alphaviruses in mosquitoes (Diptera: Culicidae) from coastal ecosystems in the Colombian Caribbean

Arboviruses belonging to the genera Flavivirus and Alphavirus were detected in mosquitoes in a rural area of San Bernardo del Viento (Córdoba, Colombia). A total of 22,180 mosquitoes were collected, sorted into 2,102 pools, and tested by generic/nested reverse transcription-polymerase chain reaction. Venezuelan equine encephalitis virus, dengue virus, West Nile virus, St. Louis encephalitis virus, yellow fever virus, and Culex flavivirus were detected and identified by sequencing. The detection of arboviral pathogens in this zone represents possible circulation and indicates a human health risk, demonstrating the importance of virological surveillance activities.

Manifestaciones clínicas y hallazgos de laboratorio de una serie de casos febriles agudos con diagnóstico presuntivo de infección por el virus dengue. Quindío (Colombia) / Clinical manifestations and laboratory findings on a case series of acute febrile syndrome with a presumptive diagnosis of dengue virus infection. Quindio, Colombia

Objetivo: Describir las manifestaciones clínicas y hallazgos de laboratorio de una serie de casos febriles agudos con diagnóstico presuntivo de infección por el virus dengue. en Quindío (Colombia). Materiales y métodos: Se realizó un estudio de corte transversal, en pacientes con sospecha clínica de dengue en el periodo comprendido entre enero y agosto de 2013, en algunos centros hospitalarios del departamento del Quindío. Se tomaron muestras de sangre para diagnóstico de dengue, leptospira, malaria, hepatitis B, y rickettsiosis. Como pruebas confirmatorias para dengue se realizó aislamiento viral en células C6/36HT y serotipificación para dengue por RTPCR; pruebas de función hepática, cuadro hemático y niveles de citocinas. Resultados: Se caracterizaron 149 casos, de los cuales el 43% presentaron infección por dengue, 4% leptospira, 6,8% rickettsias, un caso de malaria y uno de hepatitis B. En 5 casos se logró el aislamiento del DENV2 y DENV3. Mediante la RT-PCR, se evidenció cocirculación de serotipos 2, 3, 4. Se encontró que las enzimas AST/ALT, el conteo de plaquetas, la erupción y el dolor abdominal fueron marcadores característicos de la infección por dengue, mientras la ictericia y el dolor lumbar se correlacionaron con la leptospirosis. Los valores de citocinas mostraron que la IL-10, TNF α variaron significativamente en casos con dengue frente a otros diagnósticos, y la IL-17 a presentó diferencias significativas en individuos con dengue grave. Conclusiones: El dengue se confirmó como causa etiológica importante de síndrome febril icterohemorrágico en el departamento del Quindío, pero la leptospirosis y la rickettsiosis tienen también una participación importante. Sin embargo, en el 44% de los casos fueron catalogados como síndrome febril indeterminado.

Objective: To characterise the clinical and laboratory findings on a series of febrile cases with a presumptive diagnosis of dengue virus infection in Quindío, Colombia. Materials and methods: This study was conducted from January to July 2013. Blood samples were obtained from patients suspected of dengue virus infection from Quindío department hospitals. These samples were tested for dengue, leptospira, malaria, hepatitis B and rickettsiosis. To confirm dengue infection, we performed viral isolation in C6/36HT cells and dengue serotyping by RT-PCR; liver function tests, complete blood counts and cytokine levels. Results: Of 149 cases, 43% were infected by dengue, 4% leptospira, 6.8% rickettsia, one case of malaria and one case of hepatitis b. We obtained 5 clinical isolates of DENV2 and DENV3 that evidenced co-circulation of serotypes 2, 3, and 4. We found that AST/ALT levels, platelet count, rash and abdominal pain were good markers of infection by dengue, while jaundice and lumbar pain suggested leptospirosis. Cytokine levels revealed that IL-10, TNF a varied significantly in dengue compared with other diagnostics and that IL-17 α showed significant differences in individuals with severe dengue. Conclusions: Dengue was confirmed as an important aetiology of acute febrile icterohaemorrhagic syndrome in Quindío, but leptospirosis and rickettsia also play an important role. However, 44% of the cases were classified as undetermined febrile syndrome.

INDUCCIÓN DE LA PRODUCCIÓN DE LÍPIDOS TOTALES EN MICROALGAS SOMETIDAS A ESTRÉS NUTRITIVO / Induction of Total Lipids Production in Microalgae Under Nutritional Stress

Se evaluó la producción de lípidos totales en cinco especies de microalgas inducidas por la ausencia de nitrógeno. Las microalgas empleadas fueron Ankistrodesmus sp., Ankistrodesmus nannoselene, Chlorella sp., Scenedesmus sp. y Scenedesmus quadricauda. Estas especies fueron cultivadas en medio CHU10 con y sin nitrógeno. El tiempo de evaluación fue de seis días, determinándose diariamente la densidad microalgal mediante recuento en cámara de Neubahuer. Se determinó la tasa de crecimiento, la biomasa microalgal y el porcentaje de lípidos totales. Los lípidos totales fueron extraídos con solución Cloroformo:metanol (2:1). Los resultados indicaron que las especies con mayor producción de lípidos totales fueron Ankistrodesmus sp. (263,6 mg/g biomasa seca), A. nannoselene (316 mg/g biomasa seca) y Scenedesmus sp. (243,3 mg/g biomasa seca) al ser cultivadas en medios sin nitrógeno. Scenedesmus quadricauda y Chlorella sp., fueron las especies que mostraron mayor producción de biomasa seca (159,1 mg/g biomasa seca y 221,1 mg/g biomasa seca respectivamente) en medios con nitrógeno. La tasa de crecimiento fue variable entre las especies cultivadas en ambas condiciones. En conclusión, Ankistrodesmus sp., mostró la mayor tasa de crecimiento (0,77 dia-1) en medio sin nitrógeno. Bajo las mismas condiciones de cultivo, Scenedesmus sp. obtuvo la mayor producción de biomasa en peso seco (174,7 mg/l) y Ankistrodesmus nannoselene acumuló el mayor porcentaje de lípidos totales.

The production of total lipids in five microalgal species was induced by absence of nitrogen. The microalgae Ankistrodesmus sp., Ankistrodesmus nannoselene, Chlorella sp., Scenedesmus sp. and Scenedesmus quadricauda were cultured in CHU10 medium with and without nitrogen. They were evaluated during six days. The microalgae density was daily determined by a Neubahuer chamber. The average growth, total biomass and total lipids were also determined. The total lipids were extracted with chloroform: methanol (2:1). The results indicated that species with production greater amount of total lipids were Ankistrodesmus sp. (263.6 mg/g dry biomass), Ankistrodesmus nannoselene (316 mg/g dry biomass) and Scenedesmus sp. (243.3 mg/g dry biomass) when grown in media without nitrogen. Scenedesmus quadricauda and Chlorella sp. when grown in media with nitrogen showed higher amount of dry biomass (159.1 mg/g dry biomass and 221.1 mg/g dry biomass respectively) compared to those which were grown in media without nitrogen. The growth rate was variable between species grown in both conditions. In conclusion, Ankistrodesmus sp. microalgae experienced the highest growth rate (0.77 day-1) in medium without nitrogen. Under the same culture conditions, Scenedesmus sp., had the highest biomass production in dry weight (174.7 mg/l) and Ankistrodesmus nannoselene accumulated the highest percentage of total lipids.

Efectividad en el aprendizaje de la punción venosa en estudiantes de enfermería utilizando dos estrategias didácticas: "Una experiencia investigativa en aula" / Effectiveness in the Learning of Venipuncture in Nursing Students, using Two Didactic Strategies: "An Investigative Experience in Class" / Efetividade no aprendizado da punção venosa dos estudantes de enfermagem com a utilização de estratégias didáticas: "uma experiência investigativa na sala de aula"

Introducción: La punción venosa es un procedimiento asistencial que requiere entrenamiento por repetición sustentado en estrategias didácticas para generar habilidad operativa e instrumental y habilidad de pensamiento de orden superior incluida la comparación, el contraste y la transferencia del conocimiento. Objetivo: Comparar la efectividad de dos estrategias didácticas a través de la simulación clínica: "modelado docente" y "guía de procedimiento para el aprendizaje autónomo de la punción venosa" en un grupo de estudiantes de tercer semestre de enfermería en una institución de educación superior. Método: Estudio cuantitativo, observacional y evaluativo de investigación en aula, con 175 participantes, que comparó muestras con variables aleatorias, obtenidas en cinco periodos académicos entre el 2012 y el 2014, el cual buscó evaluar la diferencia establecida en las varianzas de las pruebas aplicadas. La información fue recolectada a través de la utilización de una lista de chequeo validada y el análisis de los datos fue realizado con la prueba F de Fisher. Resultados: En algunos periodos académicos, la estrategia de modelado docente presentó mejor comportamiento en el aprendizaje; en otros periodos académicos, la estrategia de la guía de procedimiento para el aprendizaje autónomo mostró mayor desempeño y al contrastar los resultados obtenidos en algunos periodos académicos no hubo diferencia significativa en las estrategias didácticas utilizadas. Conclusiones: Se demostró que ambas estrategias didácticas favorecen el aprendizaje de la punción venosa; sin embargo, la estrategia "guía de procedimiento para el aprendizaje autónomo" ofrece la misma efectividad si se utiliza sola o combinada con la estrategia "modelado docente"

Introduction: Venipuncture is a care procedure that requires training by repetition, supported by didactic strategies to generate operative and instrumental ability as well as superior order thinking abilities, including comparison, contrast and knowledge transference. Objective: To compare the effectiveness of two didactic strategies through clinical simulation: "teacher modeling" and "procedure guide for autonomous learning of venipuncture" in third semester nursing students in a university. Methodology: Quantitative, observational and evaluative study of class investigation, with 175 participants, that compared samples with random variables, obtained in five academic periods between 2012 and 2014, and that aimed to evaluate the differences established in the variances of applied tests. The information was recollected through a check list previously validated, and the data analysis was made with F-Fisher test. Results: In some academic periods, the strategy of teacher modeling presented better behavior in learning. In other academic periods, the strategy of procedure guide for the autonomous learning showed better performance; and when results in some academic periods were contrasted, there was no significant difference in the didactic strategies used. Conclusions: It was demonstrated that both didactic strategies helped the learning of venipuncture, although the strategy "procedure guide for autonomous learning" offered the same effectiveness if it was used alone or combined with the strategy "teacher modeling"

Introdução: A punção venosa é um procedimento assistencial que requer treinamento repetitivo amparado em estratégias didáticas de ensino, que gerem habilidades e capacidades operacionais e instrumentais e habilidades de pensamento de ordem superior que abranjam a comparação, o contraste e a transferência de conhecimento. Objetivo: Comparar a efetividade de duas estratégias didáticas de ensino por meio de simulação clínica: "modelagem feita pelo professor" e "aprendizagem independente com guia de procedimentos para punção venosa", em estudantes de terceiro semestre de enfermagem numa instituição de ensino superior. Materiais e métodos: Foi realizado um estudo de pesquisa observacional quantitativo e avaliativo realizado em sala de aula, com 175 participantes, para comparar amostras com variáveis aleatórias obtidas em cinco períodos acadêmicos entre os anos 2012 a 2014, o estudo avalia diferenças estabelecidas nas variâncias das provas aplicadas. As informações foram coletadas através do uso de uma lista de verificação previamente validada. A análise dos dados foi realizada com o teste de F-Fisher. Resultados: Em alguns períodos acadêmicos, a estratégia de modelagem feita pelo professor apresenta melhor comportamento no aprendizado, em outros períodos acadêmicos, a estratégia de aprendizagem independente com guia de procedimentos para punção venosa apresentou um melhor desempenho. Ao fazer a relação dos resultados obtidos entre alguns períodos acadêmicos, não se apresentaram diferenças estatísticas nas estratégias didáticas utilizadas. Conclusões: Foi demonstrado que as duas estratégias de ensino promoverão o aprendizado de punção venosa, no entanto, a estratégia "guia de procedimentos para a aprendizagem independente" oferece a mesma efetividade quando usada sozinha ou combinada com a estratégia "modelagem feita pelo professor".

GESTIÓN DE RESIDUOS SÓLIDOS EN CADENAS DE SUMINISTRO DE CICLO CERRADO DESDE LA PERSPECTIVA DE LA INVESTIGACIÓN DE OPERACIONES / SOLID WASTE MANAGEMENT IN CLOSED-LOOP SUPPLY CHAINS FROM THE PERSPECTIVE OF OPERATIONS RESEARCH

La integración de los flujos reversos y directos en la cadena de suministro, trae beneficios al reducir costos y evitar el daño ambiental porque se recupera valor de los residuos sólidos; esta integración se conoce como la cadena de suministro de ciclo cerrado. La mayoría de experiencias que relacionan cadena de suministro de ciclo cerrado y decisiones de gestión de residuos sólidos, provienen de países desarrollados con estrictas regulaciones ambientales y usan técnicas de invetigación de operaciones. El objetivo se este artículo es identificar la factibilidad de aplicar técnicas de investigación de operaciones a las decisiones de gestión de residuos sólidos en las cadena de suministro de ciclo cerrado en países en desarrollo como Colombia. Se identificaron variables importantes de los articulos revisados tales como los diferentes tipos de residuos, las regiones y el uso de técnicas de optmización, simulación y multicriterio. La metodología de vigilancia tecnológica se uso para correlacionar estas variables. Los resultados mostraron que la técnica de multicriterio es usada con más frecuencia porque permite la consideración de varios aspectos en una misma decisión; por lo tanto, el uso de esta técnica sería conveniente para enfrentar efectivamente las principales decisiones en las incipientes cadenas de suministro de ciclo cerrado en países en desarrollo.

The integration of reverse and direct flows within the supply chain is highly benefitial to reduce costs and avoid the enviromental damage because value from the solid waste is recovered; this integration is known as closed-loop supply chain. Most of the reported experiences regarding closed-loop supply chains and solid waste management decisions come from developed countries with strict environmental regulations and use of operations research techniques.This paper aims to identify the feasibility of applying operations research techniques to solid waste magement decisions within closed-loop supply chains in developing countries such as Colombia. Important variables such as the different kinds of solid waste, the regions and the use of optimization, simulation and multi-criteria techniques were identified by reviewing research articles. Technologic watch methodology was used to correlate these variables. The results showed that the multi-criteria technique is most frequently used because it allows including different aspects related to a single decision; therefore, the use of this technique would be appropiate to effectively approach the main decisions at the emerging closed-loop supply chains in developing countries.

Molecular identification of Saint Louis encephalitis virus genotype IV in Colombia

Saint Louis encephalitis virus (SLEV) is a member of the Japanese-encephalitis virus serocomplex of the genus Flavivirus. SLEV is broadly distributed in the Americas and the Caribbean Islands, where it is usually transmitted by mosquitoes of the genus Culex and primarily to birds and mammalian-hosts. Humans are occasionally infected by the virus and are dead-end hosts. SLEV causes encephalitis in temperate regions, while in tropical regions of the Americas, several human cases and a wide biological diversity of SLEV-strains have been reported. The phylogenetic analysis of the envelope (E) protein genes indicated eight-genotypes of SLEV with geographic overlap. The present paper describes the genotyping of two SLEV viruses detected in mosquito-pools collected in northern Colombia (department of Cordoba). We used reverse transcription-polymerase chain reaction to amplify a fragment of theE-gene to confirm the virus identity and completeE-gene sequencing for phylogenetic analysis and genotyping of the two-SLEV viruses found circulating in Córdoba. This is the first report of SLEV genotype IV in Colombia (Córdoba) in mosquitoes from a region of human inhabitation, implicating the risk of human disease due to SLEV infection. Physicians should consider SLEV as a possible aetiology for undiagnosed febrile and neurologic syndromes among their patients who report exposure to mosquito-bites.

Estandarización de un protocolo para Northern blot no radioactivo usado en la detección de pequeños RNA en células Vero / Standardization of Northern blot non-radioactive protocol used in the detection of small RNAs in Vero line cells

El interés en la detección, identificación, y caracterización funcional de los pequeños RNAs no codificantes (sRNAs), ha generado la necesidad de optimizar las metodologías comúnmente usadas en su detección, la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (RT-qPCR) y Northern blot, con el fin de que sean más sensibles y específicas. A pesar de la baja sensibilidad del Northern blot, esta metodología continúa siendo de uso común en la detección de sRNAs porque permite detectar el RNA pequeño así como a sus precursores, razón por la cual se usa como una metodología complementaria en este tipo de investigaciones. En este trabajo se describe la implementación de un nuevo protocolo para Northern blot no radioactivo, con modificaciones dirigidas a mejorar su sensibilidad y especificidad. El diseños de la sonda con la tecnología LNA, el marcaje de esta con Digoxigenina y por último la fijación del RNA a la membrana mediante 1-Ethyl-3-(-3-dimethylaminopropyl) carboniimide (EDC) y finalmente se discuten los fundamentos teóricos de estos cambios.

The interest in detection, identification and functional characterization of small non-coding RNAs (snRNAs), has generated the need to optimize the methodologies commonly used in its detection in specificity and sensitivity, The Quantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR) and Northern blot. Even though the low sensitivity of Northern blot, this method continues to be commonly used in the sRNAs, because its capacity to detect the sRNA and its precursor, which is the reason why Northern blot is used as complementary method in this sort of Research. This work describes the implementation of an innovative non-radioactive Northern blot protocol, with modifications that improving the sensibility and specificity, with the discussion of the theoretical foundations of such modifications.

Evaluación del mejoramiento de habilidades básicas para cirugía laparoscópica por medio del entrenamiento con un videojuego / Evaluation of Basic Skills Improvement for Laparoscopy by Training with a Video Game / Avaliação do melhoramento de habilidades básicas para cirurgia laparoscópica por meio do treinamento com um videojogo

Introducción: debido a las crecientes limitaciones éticas y de recursos en el entrenamiento de aprendices en cirugía mínimamente invasiva (CMI, E. G. laparoscopia) en pacientes, se pretende evaluar el efecto de la práctica continua con un videojuego en particular en el desarrollo de las habilidades fundamentales a la hora de ejecutar una de estas cirugías. Materiales y métodos: se seleccionaron tres actividades esenciales (corte, sutura y coordinación mano-ojo) por realizar en simuladores laparoscópicos, con el fin de establecer si la práctica con el videojuego es efectiva en el desarrollo de las habilidades necesarias en CMI. Se evaluaron en total ocho variables de desempeño en las tres actividades seleccionadas. Con base en esto, se evaluaron catorce aprendices médicos sin experiencia en laparoscopia, divididos en dos grupos (control e intervención), antes y después de un programa de entrenamiento estandarizado con el videojuego Marblemanía® y una duración de un mes. Resultados: se evidenció que la práctica continua con el videojuego Marblemanía® mejoró todas las variables de desempeño. Estos resultados positivos fueron significativamente diferentes a favor del grupo que tuvo acceso al programa de entrenamiento con el videojuego en 3 de las 8 variables de desempeño medidas en las tres actividades seleccionadas: errores en la actividad de sutura (p = 0,003), y el tiempo de ejecución y errores en la actividad coordinación mano-ojo (p = 0,025 y 0,001, respectivamente).

Introduction: Due to the growing economical and ethical limitations in surgeons training for minimally invasive surgery (MIS, e.g. laparoscopy), this study aims at evaluating the effect of a continuous practice of a particular videogame on the development of the fundamental and specific skills needed to perform this type of procedure successfully. Materials and methods: To evaluate the effectiveness of video game practicing, three essential and common activities were chosen (cutting, suturing, and eye-hand coordination) to be performed in laparoscopic simulators. Eight different indexes or variables of performance were measured in the three activities. Fourteen voluntaries without previous experience in surgery were divided in two groups (intervention and control) and their performance was evaluated before and after a one-month standardized training program with the video game Marble Mania®. Results: A general improvement of all the performance variables was observed after one month training in the intervention group. This improvement was significant with respect to the control group in three of the eight variables: suturing errors (p = 0.003), and the execution and number of errors in the eye-hand coordination (p = 0.025 and 0.001, respectively).

Introdução: devido às crescentes limitações éticas e de recursos no treinamento de aprendizes em cirurgia minimamente invasiva (CMI, e.g. laparoscopia) em pacientes, pretende-se avaliar o efeito da prática contínua com um videojogo em particular no desenvolvimento das habilidades fundamentais na hora de executar uma destas cirurgias. Materiais e métodos: se selecionaram três atividades essenciais (corte, sutura e coordenação mão-olho), a realizar em simuladores laparoscópicos, com o fim de estabelecer se a prática com o videojogo é efetiva no desenvolvimento das habilidades necessárias em CMI. Em total, avaliaram-se oito variáveis de desempenho nas três atividades selecionadas. Com base nisso, avaliaram-se catorze aprendizes médicos sem experiência em laparoscopia, divididos em dois grupos (controles e intervenção), antes e depois de um programa de treinamento estandardizado com o videojogo Marblemanía® em uma duração de um mês. Resultados: se evidenciou que a pratica contínua com o videojogo Marblemanía® melhorou todas as variáveis de desempenho. Estes resultados positivos foram significativamente diferentes a favor do grupo que teve acesso ao programa de treinamento com o videojogo em três das oito variáveis de desempenho medidas nas três atividades selecionadas: erros na atividade de sutura (p = 0.003), o tempo de execução e erros na atividade coordenação mão-olho (p = 0.025 y 0.001, respectivamente).